鉴别豚鼠的性别可以观察尿道口和肛门间的特征以及采用指压生殖嵴的方法。一手抓起豚鼠使其腹部向上，另一手拇指轻压迫会阴部，其余四肢置于臀部，观察有无阴茎的出现以及外阴部特征。雌性豚鼠在肛门和尿道口间可见一浅“U”形(或“V”形、“Y”形)皱褶，这是由阴道关闭膜形成的，阴道关闭膜仅在发情和分娩时张开，平时关闭，如以拇指和示指压迫生殖嵴使其上方轻微张开，则可使该膜显现出来。雄性豚鼠的肛门和尿道口间没有裂缝或皱褶，指压可使其阴茎伸展，雄性豚鼠还可以根据触摸到睾丸来判断，而雌性豚鼠可通过察见乳头判断，见图3-1-33。