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先天性晚发白内障FVB小鼠突变基因定位及筛选
2020年02月26日
来源:中国比较医学杂志2020年第1期
作者:庞铂实 钱强 徐园 肖君华 周宇荀 李凯
责任编辑:admin
摘要:以自发突变导致的先天性晚发白内障小鼠为模型,进行遗传方式鉴定和白内障相关基因定 位分析。
目的:以自发突变导致的先天性晚发白内障小鼠为模型,进行遗传方式鉴定和白内障相关基因定 位分析。
方法:首先通过显微镜观察组织切片鉴定白内障病理状态,其次通过构建家系确定先天性晚发白内障在 FVB小鼠中的遗传方式,其次利用多重PCR靶向测序进行100只F2代小鼠的全基因组SNP扫描定位,最后利用 全外显子测序筛选出候选突变基因。
结果:组织切片表明自发突变引起为典型白内障性状,全基因组扫描定位显 示11号染色体上的rs4228772SNP位点与白内障表型连锁程度最高;全外显子测序结果进一步表明11号染色体 上有三个基因产生了自发突变,分别是 Sfi1,Obscn 和 Ptrh2。
结论: 本研究使用全基因组SNP 扫描连锁分析与外 显子测序相结合的策略,可在已知参考基因组的物种中快速定位基因突变,结果确定了11号染色体上的三个突变 基因为先天性晚发型白内障的候选基因,并以显性方式遗传。 该策略亦可应用于其它遗传背景清晰的模式哺乳动 物的基因功能研究。
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